MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008340	CAG	2	6	261664	261669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6002	NC_008340	GCCA	2	8	261683	261690	25 %	0 %	25 %	50 %	114319389
6003	NC_008340	AGC	2	6	261716	261721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6004	NC_008340	GCC	2	6	261744	261749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6005	NC_008340	CAGGAC	2	12	261763	261774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6006	NC_008340	CAG	2	6	261823	261828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6007	NC_008340	GGCCAG	2	12	261844	261855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319389
6008	NC_008340	CGC	3	9	261859	261867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6009	NC_008340	GCA	2	6	261873	261878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6010	NC_008340	ACC	2	6	261890	261895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
6011	NC_008340	CCG	2	6	261910	261915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6012	NC_008340	AAG	2	6	261923	261928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319389
6013	NC_008340	CAA	2	6	261958	261963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319389
6014	NC_008340	CCA	2	6	261966	261971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
6015	NC_008340	CGG	2	6	261978	261983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319389
6016	NC_008340	CAGGGC	2	12	262051	262062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319389
6017	NC_008340	CAG	2	6	262063	262068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6018	NC_008340	CAG	2	6	262081	262086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6019	NC_008340	AGC	2	6	262106	262111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6020	NC_008340	GGGCCA	2	12	262119	262130	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319389
6021	NC_008340	GCC	2	6	262163	262168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6022	NC_008340	GGGT	2	8	262193	262200	0 %	25 %	75 %	0 %	114319389
6023	NC_008340	AGC	2	6	262226	262231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6024	NC_008340	AGC	2	6	262241	262246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6025	NC_008340	CACGG	2	10	262258	262267	20 %	0 %	40 %	40 %	114319389
6026	NC_008340	CAG	2	6	262294	262299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6027	NC_008340	GCG	2	6	262319	262324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319389
6028	NC_008340	CCGGG	2	10	262374	262383	0 %	0 %	60 %	40 %	114319389
6029	NC_008340	GCCA	2	8	262397	262404	25 %	0 %	25 %	50 %	114319389
6030	NC_008340	ACC	2	6	262406	262411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
6031	NC_008340	CAG	2	6	262447	262452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6032	NC_008340	GAA	2	6	262453	262458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319389
6033	NC_008340	CAG	2	6	262477	262482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6034	NC_008340	TGTC	2	8	262799	262806	0 %	50 %	25 %	25 %	114319390
6035	NC_008340	CAT	2	6	262873	262878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319390
6036	NC_008340	GAC	2	6	262957	262962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6037	NC_008340	GTG	3	9	262966	262974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319390
6038	NC_008340	CGG	2	6	262986	262991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
6039	NC_008340	GC	3	6	263012	263017	0 %	0 %	50 %	50 %	114319390
6040	NC_008340	CTG	2	6	263041	263046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6041	NC_008340	CTG	2	6	263068	263073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6042	NC_008340	GGC	2	6	263136	263141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
6043	NC_008340	CCA	2	6	263159	263164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319390
6044	NC_008340	TGG	2	6	263171	263176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319390
6045	NC_008340	TGG	2	6	263221	263226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319390
6046	NC_008340	CAA	2	6	263259	263264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319390
6047	NC_008340	CGC	2	6	263292	263297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319390
6048	NC_008340	GCG	2	6	263311	263316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
6049	NC_008340	CGC	2	6	263408	263413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319390
6050	NC_008340	CAG	2	6	263455	263460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6051	NC_008340	CTG	2	6	263569	263574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6052	NC_008340	GCT	2	6	263640	263645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6053	NC_008340	GTC	2	6	263702	263707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6054	NC_008340	GGC	2	6	263745	263750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319390
6055	NC_008340	GCT	2	6	263751	263756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319390
6056	NC_008340	GCC	2	6	263939	263944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
6057	NC_008340	CTT	2	6	263954	263959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319391
6058	NC_008340	GCC	2	6	263963	263968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
6059	NC_008340	GCC	2	6	263978	263983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
6060	NC_008340	CCG	2	6	263985	263990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
6061	NC_008340	CGC	2	6	264062	264067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319391
6062	NC_008340	GCG	2	6	264118	264123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319391
6063	NC_008340	TGAT	2	8	264450	264457	25 %	50 %	25 %	0 %	114319392
6064	NC_008340	TCCAC	2	10	264475	264484	20 %	20 %	0 %	60 %	114319392
6065	NC_008340	CAGGCC	2	12	264518	264529	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319392
6066	NC_008340	C	6	6	264574	264579	0 %	0 %	0 %	100 %	114319392
6067	NC_008340	GGC	2	6	264580	264585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319392
6068	NC_008340	GTC	2	6	264830	264835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319392
6069	NC_008340	CTG	2	6	264893	264898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319392
6070	NC_008340	GGC	3	9	264899	264907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319392
6071	NC_008340	GTG	2	6	264948	264953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319392
6072	NC_008340	CGA	2	6	265130	265135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319393
6073	NC_008340	T	6	6	265151	265156	0 %	100 %	0 %	0 %	114319393
6074	NC_008340	ATG	2	6	265188	265193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319393
6075	NC_008340	TCA	2	6	265195	265200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319393
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6078	NC_008340	GGC	2	6	265387	265392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319394
6079	NC_008340	CTG	2	6	265394	265399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
6080	NC_008340	GCC	2	6	265520	265525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319394
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6084	NC_008340	GCA	2	6	265636	265641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319394
6085	NC_008340	GGT	2	6	265647	265652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319394
6086	NC_008340	CAT	2	6	265666	265671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319394
6087	NC_008340	GAGCCC	2	12	265748	265759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319394
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6090	NC_008340	GC	4	8	265827	265834	0 %	0 %	50 %	50 %	114319394
6091	NC_008340	CTG	2	6	265895	265900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
6092	NC_008340	TGC	2	6	265917	265922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
6093	NC_008340	CGGC	2	8	265956	265963	0 %	0 %	50 %	50 %	114319394
6094	NC_008340	CTGCCG	2	12	265976	265987	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319394
6095	NC_008340	GCCT	2	8	265997	266004	0 %	25 %	25 %	50 %	114319394
6096	NC_008340	ACG	2	6	266013	266018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319394
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6099	NC_008340	GCATC	2	10	266173	266182	20 %	20 %	20 %	40 %	114319394
6100	NC_008340	GGCC	2	8	266266	266273	0 %	0 %	50 %	50 %	114319394
6101	NC_008340	TGT	2	6	266274	266279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319394
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6103	NC_008340	CTG	2	6	266321	266326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
6104	NC_008340	GC	3	6	266327	266332	0 %	0 %	50 %	50 %	114319394
6105	NC_008340	CGG	2	6	266345	266350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319394
6106	NC_008340	TGA	3	9	266361	266369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319394
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6108	NC_008340	TCT	2	6	266397	266402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319394
6109	NC_008340	GCT	2	6	266416	266421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319394
6110	NC_008340	CG	3	6	266435	266440	0 %	0 %	50 %	50 %	114319394
6111	NC_008340	TGGC	2	8	266447	266454	0 %	25 %	50 %	25 %	114319394
6112	NC_008340	GGT	2	6	266479	266484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319394
6113	NC_008340	GGGC	2	8	266500	266507	0 %	0 %	75 %	25 %	114319394
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6116	NC_008340	TCT	2	6	266881	266886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319395
6117	NC_008340	ACG	2	6	267007	267012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319395
6118	NC_008340	CCT	2	6	267150	267155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319396
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6120	NC_008340	CCA	2	6	267186	267191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319396
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6351	NC_008340	TTCCTC	2	12	277757	277768	0 %	50 %	0 %	50 %	114319405
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6357	NC_008340	CGCGC	2	10	277858	277867	0 %	0 %	40 %	60 %	114319405
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6361	NC_008340	CCT	3	9	277942	277950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319405
6362	NC_008340	TCC	2	6	277962	277967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319405
6363	NC_008340	CGG	2	6	277977	277982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319405
6364	NC_008340	CGG	2	6	277993	277998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319405
6365	NC_008340	CTCGCG	2	12	278000	278011	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319405
6366	NC_008340	TCGCCG	2	12	278061	278072	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319405
6367	NC_008340	CTC	2	6	278078	278083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319405
6368	NC_008340	GCA	2	6	278095	278100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319405
6369	NC_008340	GCA	2	6	278140	278145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319405
6370	NC_008340	CGGCC	2	10	278166	278175	0 %	0 %	40 %	60 %	114319405
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6372	NC_008340	TCA	2	6	278252	278257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319406
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6375	NC_008340	GTA	2	6	278442	278447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319406
6376	NC_008340	GTCCAC	2	12	278526	278537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319406
6377	NC_008340	AGC	2	6	278548	278553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319406
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6380	NC_008340	GCCT	2	8	278694	278701	0 %	25 %	25 %	50 %	114319407
6381	NC_008340	CGG	2	6	278705	278710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319407
6382	NC_008340	GTTGC	2	10	278733	278742	0 %	40 %	40 %	20 %	114319407
6383	NC_008340	CTC	2	6	278757	278762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319407
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6385	NC_008340	CTG	2	6	278910	278915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319407
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6391	NC_008340	CCG	2	6	279214	279219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319407
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6400	NC_008340	TCG	2	6	279835	279840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319408
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6434	NC_008340	TGG	3	9	281083	281091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319408
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6443	NC_008340	CCT	2	6	281380	281385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319408
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6470	NC_008340	TGA	2	6	283253	283258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319410
6471	NC_008340	GCT	2	6	283278	283283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319410
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6473	NC_008340	CCG	2	6	283313	283318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
6474	NC_008340	CGC	2	6	283326	283331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
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6476	NC_008340	CAC	4	12	283386	283397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319410
6477	NC_008340	ACGCC	2	10	283464	283473	20 %	0 %	20 %	60 %	114319410
6478	NC_008340	GGT	2	6	283491	283496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319410
6479	NC_008340	ATC	2	6	283582	283587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319410
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6481	NC_008340	GGC	2	6	283714	283719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
6482	NC_008340	CCG	2	6	283724	283729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
6483	NC_008340	CCG	2	6	283782	283787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
6484	NC_008340	GC	3	6	283797	283802	0 %	0 %	50 %	50 %	114319410
6485	NC_008340	CGA	2	6	283893	283898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319410
6486	NC_008340	AC	3	6	283926	283931	50 %	0 %	0 %	50 %	114319410
6487	NC_008340	CGG	2	6	284031	284036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
6488	NC_008340	CGCCAC	2	12	284070	284081	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114319410
6489	NC_008340	CGG	2	6	284102	284107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
6490	NC_008340	CCG	2	6	284147	284152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
6491	NC_008340	GGC	2	6	284166	284171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
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6495	NC_008340	TGA	2	6	284618	284623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319411
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6500	NC_008340	GAG	2	6	284743	284748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319411

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